Es gibt verschiedene Fanconi-Syndrome, man unterscheidet: Fanconi-Anämie: Krankheit, bei der Kinder angeborene Fehlbildungen (z. B. fehlender Daumen, Nierenfehlbildungen, Minderwuchs, usw.) und eine Störung im blutbildenden Knochenmark (Anämie) haben. Weiterhin äußert sie sich in fleckenförmigen Pigmentstörungen. Mit steigendem Alter kommt es zur Zunahme von Erkrankungen.

• Fanconi-Hegglin-Syndrom: Eine wahrscheinlich durch Bakterien verursachte Infektion der Atmungsorgane. Äußert sich in: Husten, Heiserkeit.
• Fanconi-Schlesinger-Syndrom: Krankheit, bei der der Patient durch Regulationsstörungen des Calcium-.und Phosphatstoffwechsel einen erhöhten Calciumspiegel im Blut hat. Äußert sich in: Verdickung der Knochen, Verkalkungen der Weichteile, Veränderungen am Herzen, Verkalkung der Nieren.