Unter der Darmflora versteht man die in bestimmten Darmabschnitten lebenden Mikroorganismen (100-400 Bakterien-Arten, z. B. Escherichia coli, Bacillus acidophilus). Diese Mikroorganismen helfen bei der Verdauung der Nahrung und sind wichtig für das Abwehrsystem des Körpers im Darm. Die D. kann durch Antibiotika (Antibiotikum) oder andere Medikamente geschädigt werden, was z. B. zu Durchfall führen kann.